玛娅是联盟学院的学生，专门研究宇宙地质学。某日，她在教授的带领下去探查欧力哈鲁特矿石，可是在探查路中遭遇了风暴，唯利是图的教授竟然抛弃了意识还留在I机械上的玛娅，自己乘着载有玛娅身体的飞船逃跑了。无处可归的玛娅被挖掘公司埃斯卡维特的人收留，挖掘公司的人答应带她回驿站，但条件是她得在这艘飞船上协助他们进行欧力哈鲁特矿石的挖掘工作。

埃斯卡维特公司帮玛娅找回了自己的身体，但是玛娅的教授将自己的罪行全部诬陷给了玛娅，现在的她如果回到驿站就会被立刻逮捕。无奈之下玛娅只好成为了埃斯卡维特公司的正式员工，协助公司挖掘欧力哈鲁特矿石。公司接下新的委托，在一颗新发现的行星上进行挖掘工作。但是这个行星上的风暴超过了观测史上最高的第5等级，想要进行挖掘工作将会非常困难。不过这次的挖掘任务酬劳非常丰厚，公司决定接下这桩大生意。

埃斯卡维特公司开始在新的行星上进行矿石探查，令人惊讶的是这里的欧力哈鲁特矿石纯度竟然高达100%，大家还没来得及高兴，一个神秘的现象突然发生了。观察装置内的气压急速升高，矿石开始出现发光现象，大家都以为是转变现象，不料竟然从矿石里出现了一个少女，这名少女没有穿宇航服，却能自由的在宇宙中呼吸。与此同时，行星联盟军的星际飞船突然现身，想要对埃斯卡维特公司进行制裁。

埃斯卡维特公司躲开了行星联盟军的追击，带着在行星上发现的神秘少女逃到了N宇宙区域，这里是米格尔网络外的未开发区域。公司决定绕路从宇宙边境返回米格尔网络区域，但是这需要花费将近两个月时间，这就意味着大家在这两个月里得不到任何新的信息和资讯。船长要审问那位陷害他们的女军人，这次联盟军的行动应该不止回收矿石这么简单。

从欧力哈鲁特矿石中出来的小女孩疑团重重，卫星离开新行星追逐埃斯卡维特公司的飞船，很有可能就是为了这个小女孩。在逃亡的路线上突然检测到了特定光谱，那是突然出现的宇宙尘。船长决定从穿过分子云，保持原有轨道。但是在穿越分子云的过程中，船舱内突然遭到宇宙尘入侵，它针对的目标就是那个矿石中出现的小女孩。

伊度找回了自己的记忆，从他的记忆里大家得知从从欧力哈鲁特矿石中出来的小女孩名叫爱丽丝。爱丽丝遭到了宇宙尘的袭击，伊度奋起保护，他发誓要守护自己的过去。船长下令让阿曼札和米拉去协助伊度，他们计划在十分钟后传送逃脱分子云。就在大家奋力对抗宇宙尘的时候，远处突然出现了军队的I机械。面对军队和宇宙尘的双重夹击，伊度他们要如何才能脱险？

伊度为救爱丽丝自己被岩石卷走，爱丽丝和玛娅也未能幸免。吞噬了众人的岩石准备通过米格尔脱离离开现场，阿曼莎乘着挖掘机追上了里克，跟岩石一起进行了米格尔脱离来到了普通空间。被困在岩石内部的伊度和玛娅清醒后分析了现在的状况，玛娅的宇宙服只能再坚持112分钟，两个小时内如果没有逃脱出去，那玛娅就会有生命危险。但是岩石内部隔断了所有通讯信号，他们要如何跟岩石外的阿曼莎和里克联系呢？

众人从载人探测船中取回的航行日志内得到了意外的新信息，移动天体拉基普是未知文明创造的，它的目的是回收欧力哈鲁特矿石。欧力哈鲁特矿石对人类的生存至关重要，但是对未知文明却是一种威胁和阻碍。众人意识到现在大家触及的是机密情报，面前只有两条路可选，一是投降让联盟抓走；二是尽快逃离躲避联盟和移动天体的追击。伊度提出了第三种选项，他想去调查航行日志里提到的阿利斯伽瓦博士。

面具男隐瞒了米格尔米格尔网络大规模受害事件的真相，各殖民地受害严重，居民纷纷逃亡避难。面具男的真实目的是消灭移动天体拉基普，但是要消灭移动天体拉基普就得动用现在联盟政府所拥有的全部欧力哈鲁特矿石，这样做会使整个联盟经济崩溃，但面具男依然一意孤行。

亚当斯自称是伊度以前的盟友，他称伊度的真实身份是凯恩，并且还拥有着伊度的克隆体。伊度在与亚当斯的战斗中显得非常不自然，亚当斯将伊度的精神放入到克隆体内，这是伊度十年间第一次回到肉体，曾经消除了伊度记忆的亚当斯打算恢复他的记忆，他想要在伊度充满罪孽的记忆中寻找到对付拉基普的方法。

联盟军正在整个米格尔网络区域内收集欧力哈鲁特矿石，他们准备将这些矿石作为引诱拉基普的诱饵，然后用欧力哈鲁特弹将拉基普除掉，经过查询后发现联盟作战的地点竟然是地球圈。社长决定在军队与拉基普交战前停止一切活动，但伊度明白现在的亚当斯根本没有掌握打败拉基普的方法，拥有凯恩记忆的他坚持以伊度的身份阻止亚当斯并夺回爱丽丝。

爱丽丝找回了自我，现在的她恢复了珍妮弗的记忆，清醒过来的她急切的想找到爱丽丝。当年珍妮弗将伊度送到流放船一年之后，自己利用MT系统进行了精神转化，她将自己的意识直接转移到了爱丽丝转移后留下的欧力哈鲁特矿石碎片上。珍妮弗明知这样做会永远无法恢复自己的模样，但这都是为了在茫茫欧力哈鲁特矿石中寻找爱丽丝。亚当斯痛恨这一切的始作俑者，那就是当年对爱丽丝不屑一顾的凯恩，如今的伊度。