人类获得了高度进化的情报技术“玛那”，凭借这魔法般的力量，地球终于迎来了和平与自由的理想乡。米斯尔奇皇国的第一公主安琪莉洁，深受民众的祝福与爱戴，在“洗礼仪式”上她突然被揭发是“诺玛”的事实。“诺玛”是无法使用玛那之力的非正规者，是反社会且无法称其为人的“物品”。一无所有的她被隔离到偏僻的岛屿“阿尔泽纳尔”，受尽凌辱后她将如何生存……

安琪被分配到帕拉梅尔（Para-mail）第一中队，见到了队长佐拉，副队长萨莉亚，突击兵希尔达、薇薇安、罗萨利等人。安琪还是不愿承认自己诺玛的身份，在基地内与同伴发生冲突。萨莉亚负责训练安琪，安琪对战机非凡的操控能力让所有人对她刮目相看。安琪不满基地的生活，仍旧幻想着回到皇国，佐拉企图侵犯安琪，这时警报响起……

大批龙入侵，安琪等人被派去迎敌。看到身边的伙伴被龙生吞，安琪陷入极度恐慌，失去理智的她害死了作战中的佐拉。面对希尔达她们的指责，安琪毫无愧疚，并说“诺玛又不是人”。吉尔告诉安琪米斯尔奇皇国已经不存在的事实，安琪心灰意冷一心求死，驾驶Villkiss前往战场却在战斗中找到活下去的勇气。安琪斩断长发，斩断了过去的一切，她将作为一名诺玛生存。

吉尔和萨莉亚等人谋划着自由之战，安琪和她所驾驶的机体“Villkiss”是他们计划的核心。安琪虽然战斗力极强，但是她害死了新兵和佐拉，因此遭人怨恨。罗萨利想尽办法捉弄安琪，安琪对此毫不在乎，坚持独善其身的原则。安琪出战对抗龙，她的机体突然起火，与龙一同被卷入漩涡之中……

流落荒岛的安琪被神秘青年塔斯克所救，她误以为塔斯克是色狼，于是打伤他逃走。安琪发现机体损坏严重，她暂时无法离开这里。这时森林突然下起暴雨，安琪在慌乱中不慎被毒蛇咬伤，关键时刻塔斯克再次救了她，安琪开始信任塔斯克，两人在小岛上共同生活着。突然小岛遭遇飞龙袭击，两人陷入危机……

安琪曾经的首席侍女桃香闯入阿尔泽纳尔基地，只为留在安琪身边照顾她。桃香仍旧把安琪当做“安琪莉洁大人”，安琪对此十分反感，两人间充满隔阂。安琪从希尔达那里听说，知道基地秘密的桃香只要回国，就会被立马处死。安琪劝说桃香离开，但桃香执意留下。安琪下定决心，无论如何她都要保护桃香。

安琪依旧我行我素，这使得她所在中队的团队默契完全崩坏。身为队长的萨莉亚对安琪的行为十分不满，她承受的压力越来越多。无奈之下，萨莉亚按照以往的“美少女Cosplay法”缓解自身压力，却没想到被碰巧出现的安琪看到了这一幕。情绪失控的萨莉亚在浴室找到安琪，两人扭打成一团。此时未知的大型龙来袭，萨莉亚等人陷入危机……

安琪由于妹妹西尔维娅的求救通讯，使得她打算与过去诀别的心意产生动摇。此时正值一年一度的美人鱼庆典，安琪等人穿上比基尼上街游玩。罗森布尔姆国的皇女米斯提·罗森布姆来到阿尔泽纳尔进行探访活动，想要见到安琪。安琪威胁米斯提作为人质，准备回国拯救西尔维娅，此时她遇到了同样打算逃走的希尔达……

安琪与希尔达顺利逃脱，安琪一路闯入米斯尔奇皇国，前去拯救妹妹西尔维娅。在另一边，希尔达终于回到家乡，与思念已久的母亲重逢。但是背负着诺玛之名的两人，却不被亲人所接受。妹妹西尔维娅对安琪刀剑相向，并率军队围困她；希尔达遭到母亲呵斥，家里早已没有她的容身之处了。

安琪遭皇妹西尔维娅鞭刑，并被皇兄朱利奥送上绞刑架，昔日的好友也全都抛弃了她。面对歧视与偏见，安琪对人类的和平世界彻底心灰意冷。关键时刻，岛上的旧识塔斯克前来相助，安琪与桃香顺利逃脱，回到阿尔泽捷纳尔。安琪被处罚禁闭一周，在监狱里她见到了同样遍体鳞伤的希尔达。

西尔维娅窥得皇兄朱利奥与近卫队长的秘密而身陷危机。在另一边，不明机体拉格朗梅尔（Ragna-mail）带领大批飞龙袭击阿尔泽纳尔的司令部，所有队员进入战斗状态，萨莉亚违抗吉尔的命令驾驶Villkiss迎敌。此时桃香趁乱救出安琪和希尔达，安琪在希尔达的帮助下夺回机体，与神秘歌之少女展开激烈对战。

朱利奥对安琪怀恨在心，在创世主恩布利欧的默许下，打算彻底消灭诺玛。上次的袭击使司令部遭到重创，在安琪的追问下，吉尔将自由圣战的秘密告诉了她，而吉尔竟然是史上第一位皇室诺玛！就在此时，薇薇安突然惊变龙，不明真相的队员们对薇薇安展开攻击，只有安琪发现了端倪……

朱利奥带领所谓的诺玛国际救助舰队来到阿尔泽纳尔，吉尔带领队员们与其对抗，自由圣战计划Libertas开始。朱利奥的目标是俘获安琪和Villkiss，安琪遇到了恩布利欧，并从他那里得知了朱利奥的丑恶罪行，安琪决定驾驶Villkiss讨伐自己的皇兄。然而就在安琪要手刃亲哥哥的时候，驾驶黑色Ragna-mail的恩布利欧却出现了……

安琪和塔斯克坠落到莫名其妙的孤岛，薇薇安又变回飞龙，无奈之下他们只有先调查此地。然而安琪意外发现，这片废墟竟是她的故乡米斯尔奇皇国，这让她困惑不已。此时突然出现的智能机器人在四处搜索幸存者，安琪与塔斯克跟随机器人，进入首都防卫机构，终于明白了世界的真相。

安琪和塔斯克被龙族带到了大女巫面前，面对龙族等人的质问，安琪试图反抗。此时，安琪再次见到了命运中的少女，弗雷亚一族的公主、近卫中将萨拉曼蒂妮。萨拉曼蒂妮请求留安琪一命，并亲自招待了他们二人。原来龙族也是人类，而龙族所在的星球竟是另一个被抛弃的地球……

安琪了解了龙族的秘密，她与塔斯克暂时被软禁在龙族，恢复了龙族身份的薇薇安与亲生母亲重逢。萨拉曼蒂妮向安琪发起挑战，以战斗的名义决定安琪与塔斯克的去留。萨拉曼蒂妮与安琪在体育馆的比试不分上下，不打不相识的两人渐渐生出了情谊。此时异变突起，龙族突然遭遇不明袭击，安琪驾驶Villkiss出战！

龙族听闻奥拉在米斯尔奇秘密基地下的情报，为了夺回始祖之龙“奥拉”，决定集结所有兵力对米斯尔奇展开大规模攻击。面对一触即发的战争，安琪徘徊在虚假与真实之间，烦恼着怎么做才是正确的选择。看着为了生存挣扎的龙族，安琪决定回到原来的世界，而薇薇安在母亲的理解下，与安琪一同踏上归途。和龙大军穿越奇点的安琪，出现在他们面前的却是3台黑色的Ragna-mail……

安琪一行人与希尔达等人重逢，并在空母Aurora上跟众人会合。安琪提出与龙联手的作战策略，但吉尔却坚持只有杀死恩布利欧才能彻底解放诺玛。面对吉尔的偏激理论，安琪产生了反感。最终吉尔决定听取安琪的建议，但吉尔并不是真心与龙合作，而是要把龙当做炮灰利用？！

安琪救走桃香，与薇薇安、塔斯克逃往特异点。此时萨莉亚带领“钻石玫瑰骑士团”出现，对安琪等人展开追击，并开枪击落了安琪。昏迷的安琪醒来后发现自己身处米斯尔奇皇国，而获救的萨莉等人成为了恩布利欧的部下。在图书馆，安琪见到了妹妹西尔维娅和恩布利欧。安琪枪击恩布利欧，恩布利欧却无穷地复活，而恩布利欧的真实身份竟是时空调律者。恩布利欧试图催眠安琪，对其凌辱……

安琪的逃走让吉尔十分愤怒，她把过错全赖在塔斯克身上，并不打算救援安琪；希尔达察觉到吉尔跟恩布利欧过去有着不寻常的关系。在另一边，安琪受邀与恩布利欧见面，没想到恩布利欧竟提出要娶她为妻，躲在一旁听到此事的萨莉亚醋意十足。恩布利欧想要融合两个地球创建新世界，安琪趁其不备袭击了他，却被恩布利欧施与无穷的痛苦而折磨着。感觉又一次被安琪夺去一切的萨莉亚，决定偷偷地释放了安琪。

塔斯克和希尔达等人策划冲入米斯尔奇皇国。此时安琪带着桃香驾驶Villkiss逃走，遇到了萨拉曼蒂妮的军队，而萨拉曼蒂妮的目标正是奥拉。希尔达等人与安琪会合，然而钻石玫瑰骑士团突然发起攻击，致使Villkiss坠入大海，所幸安琪和桃香并无大碍。战斗仍在继续，钻石玫瑰骑士团的克莉丝对过去的朋友罗萨莉和希尔达无情的狂攻。另一方面，恩布利欧对安琪穷追不舍，这时塔斯克出现。

恩布利欧激活Ragna-mail，而放走了安琪的萨莉亚惨遭遗弃。萨拉曼蒂妮和希尔达等人得知安布利欧的计划后决定结盟，但安琪此时仍下落不明。发现自己被恩布利欧欺骗利用的艾尔莎向Aurora投诚。在另一边，安琪独自来到与塔斯克初遇的岛上，桃香和塔斯克的死让她悲痛欲绝。恩布利欧让所有人都无法使用玛娜，他的新世界计划开始了……

在恩布利欧的计划下，时空融合开始了，而时空融合的中心点正是米斯尔奇的晓之御柱。为了拯救地球，萨拉曼蒂妮等人决定夺回奥拉。就在大家准备出击时，意外收到了安琪归舰的消息。安琪找到吉尔，询问她杀死恩布利欧的方法。希尔达提议将司令官让位给安琪，并对安琪告白：“你是我的王子殿下。”安琪的一番感言后，宣布作战“Last Libertas”开始，大队向米斯尔奇皇国进发，恩布利欧的Ragna-mail部队“钻石玫瑰骑士团”阻拦在她们面前。

为了阻止时空融合的战斗持续着，找到了奥拉的萨拉曼蒂妮却无法打开防护罩，唱起龙之歌的她准备输出最大的能量。与恩布利欧对峙的塔斯克说起了与安琪亲密的事情，这让恩布利欧恼羞成怒，寡不敌众的舰队遇到了危机，而奥拉的子民通过特异点前来援助，紧迫的局势开始转变。

恩布利欧将安琪带到了时空的间隙，这里是阿尔泽纳尔的原型，在这里时间不会流逝而安布利欧作为调律者的事情也全都从这里开始。在奥拉努力制止时空融合的时候安琪遇到了危险，在恩布利欧的强迫下安琪并没有屈服，安琪的歌声启动了Villkiss，为了保护同伴和拯救世界，塔斯克等人立即赶往救援。