纯一今天也在不知不觉间进入了某人的梦。对梦中出现的少女的影子有些印象，不过，却不记得是谁，这时，妹妹音梦将纯一拉回了现实生活。在总是不变的日常生活中，这天，在美国的青梅竹马芳乃樱突然回国了，静止的时间一点点开始动了起来……

在纯一的房间里，音梦看到了樱与纯一接吻的场面。从早上开始音梦就闹起了别扭。必然对纯一解开误会的话语完全听不进去，纯一也尽力了，冰冷的气氛围绕在兄妹之间。二人能否再次和好？…

彼此的误解也解开了，心情愉快纯一和音梦来到了学校。在校内，后辈美春的班级前挤满了人。原来是美春遭遇了事故。听到那这些的音梦休克过去，纯一也是惊讶。但是在纯一和音梦前，出现了一个受了伤美春。她是被制作出来的和美春一模一样的机器人。这些事，只有纯一知道……

有那样身姿的白河小鸟让风见学园全体男生都憧憬是理所当然的事，而且她还对人温柔，除此之外，传言她还有着能听到对方的心声秘密。午饭的时候，意想不到的契机让小鸟认识了纯一，纯一也亲身体会到了她温柔的照料。但是，小鸟的有读懂人心的能力吗……

睡了懒觉的纯一旷课散步去了。在散步的途中，救下了一个在公园被孩子们欺负的女孩子。但是，那个女孩子是猫耳女仆打扮。纯一有帮助她的想法，杉并参与其中，并建议让她住到仓朝家。无法拒绝他人恳求的纯一，将女仆鹭泽赖子带回了家…

初音岛迎来了盛夏！纯一一行人外出到初音岛内的某个海边。在一个人也没有的海岸，热闹的就数女孩子们每个人都向纯一他们展示各自的泳装。看到这番景象纯一他们满面微笑，但对音梦来说很没意思，对于一直都很迟钝的纯，终于音梦一个人默默地离开那个地方…

像往常一样在屋顶吃火锅水越姐妹。今天的食材是鸭子！但是，这是一只活鸭子，在做熟前逃跑了，姐妹两人和纯一慌忙捕获，结果被白河老师发现了。事后萌对那样的纯一道歉，并且想把纯一带到水越家用晚宴招待。放学后，成为水越姐妹的向导水越来家里一看，原来是大豪宅。其实是萌和真子初音岛屈指可数的大小姐…

前面剧情的总集，以歌丸的角度叙事。

有一天早上，音梦收到寄信人不明的鲜红玫瑰花束，还附带着神秘的诗。音梦认为是纯一的恶作剧，但其实不然。而且，在上学的时候也看到了那首诗和玫瑰花束，这些东西一直在出现在音梦的身边。纯一认为这是音梦的跟踪狂…

风见学园的学园祭，每个社团都在尽自己的一份力。纯一被要求让小鸟也去参加选美比赛，虽然纯一硬着头皮前去找她，但还是无法开口。然而，小鸟同意了出场。而且，纯一也答应了声乐部的演唱会的邀请…

女仆赖子寄宿在朝仓家。作为女仆的最低限度她已经可以做饭洗衣等等，然而赖子却一直呆在家里，得了完全无法走出去的“外出恐惧症”。纯一对一步也无法走出去的赖子为难了，他想要让她看一看外面的世界是多么有趣，进行了各种各样的策划…

真子突然说出了希望成为“恋人”的告白，被强迫纯一感到了困惑，其实这是真子的女孩子后辈很崇拜真子，所以想要扮成恋人的样子，这孩子放弃。纯一被迫接受了。然后两人一起回家，在休息日约会等，笨拙的情侣游戏的日子持续着…

纯一一行人来到了初音岛主题公园“热带丛林王国”，玩了游泳池，烧烤，浴场等等。随后玩累了的一行人去了温泉，萌没有赶上并且迷路了，于是混进了饲养鸵鸟的小屋…

课结束后放学了，美春来到纯一面前，说原本打算和音梦购物去，但音梦先回去了，所以纯一就代替音梦和美春一起去。在别人看来，这就是在约会，发现了这一点的纯一，为了不被别人发现开始逃跑……

前半部分的回顾，到现在为止故事的总集篇。而且只是的总集篇而已。杉并说：“即使是总集篇初音岛那如云的美女还是会让人感到心动”。到现在为止，经历了赖子的过去，风见学园文化祭的回忆，和真子装扮情侣的游戏等大家的各种趣事。

樱发现音梦的手指上的戒指，并且听说了这个戒指是纯一送的礼物，自己也想要纯一送的礼物。此时纯一没有发现音梦复杂的感情，于是答应了送樱礼物。但樱并不想要戒指，而是别的想要的东西……那样的樱所希望的礼物，到底是什么呢？

樱把纯一邀请到家里玩。于是，纯一做了令人怀念的梦。那是和小樱初次相遇时候的梦……。另一方面，音梦和美春一起去看了电影。第一次去看电影的美春过于兴奋，身体突然冒起了烟。随后，音梦知道了美春的身份。

看到小樱与纯一在一起的样子与平时不同，音梦受到了打击。纯一，会选择樱吗？音梦只是在流泪。之后，音梦以真正的心情去面对。纯一也把自己年幼时候的想法改变了……。两人的关系发生了变化。

纯一和音梦相互表达了自己的心情，确认了恋人的关系。这样一来，在总是不变的日常生活都会感觉幸福。但是，即使没有血缘关系，两人依旧是兄妹，这是杉并的话让纯一动摇了。然后纯一想着樱这样的存在，两人之间的关系注定了起伏。

樱发现了纯一和音梦之间有新的关系。纯一也亲口说出了和音梦成为了恋人的话，樱也道出了对纯一的喜欢之情。随后音梦赶到两人身边，看到那样的樱的身影。站在音梦和樱两人的深深思念之间，纯一选的人是……。

樱知道了纯一对音梦的思念，勉强抱着痛苦的心情，像往常一样轻松地去学校。但是，在那里听说了音梦昨晚住院的事，并且出现了很奇怪的状况，樱听了愕然。小樱想起了保护自己的樱花魔法……。

为了救音梦，樱做了一个决定，那就是让保护自己的魔法樱花树凋零。但是，这也意味着所有的魔法都消失的意思。当然，赖子身上的魔法也会解开。在樱凋谢的日子，赖子和纯一的约会只有这一夜。……制作赖子最后的回忆开始了。

樱花树的魔法解开了。同时，小鸟也失去了读懂人心的能力。因为能力渐渐消失，小鸟被不安压垮。虽然小鸟的耳朵谁的声音都听不见，但不知为何可以听到纯一的心声。放心了的小鸟，和往常一样在纯一的身边……。

美春病倒了。得到这个消息的纯一跑到了医院。在那里的是机器人美春和真正美春两人。在情况逐渐走向好转的真正的美春背后，机器人美春的“生命”即将到了尽头。美春一直在寻找不存在的“回忆”，痛苦着……。

尽管樱花凋谢了，所有的魔法都解开了。但音梦的病又犯了。音梦仍然从嘴唇咳出了樱花的花瓣。发现了这一情况的樱，到本应该凋零的樱花树前确认。但是，在那里樱所看到的是疯狂般生长的灿烂盛开的樱花树。

音梦的记忆逐渐消失。对于纯一的事，那是音梦仅剩的最重要的回忆，因此音梦走到樱花树林去了。另一方面，纯一追寻着那样的音梦，樱拼命的让樱花树枯萎。在不枯萎的樱花树下，三人的感情结局……。