“杰尼提克斯”是一所负责培育战斗少女．潘多拉的作战学校，目的为对抗袭击人类的异次元体“NOVA”。在校内举办的名为“嘉年华”的官方比赛中，莎堤莱萨．艾尔．布丽姬凭藉着其压倒性的力量与威力惊人之武器，将朝她攻击而来的同学一一击退……！？

青井和哉刚进入杰尼提克斯就读的第一天，就被卷入嘉年华比赛。他将莎堤莱萨误认为是已过世的姐姐，并忍不住跑过去抱住她，没想到此举却让莎堤莱萨发动冰冻结界，最后还害莎堤莱萨失去学年第一名的宝座。和哉虽然想向她道歉，但却被学生会长阻止……？

莎堤莱萨与加妮沙一战后，担任班长的柊劝告和哉“最好不要再跟莎堤莱萨有所瓜葛”，但和哉却对此感到反感，甚至在午休时跑去找莎堤莱萨。当和哉与莎堤莱萨聊过，知道她的内心相当温柔之后，再次主动要求成为莎堤莱萨的制御者。没想到此时却出现三年级的神无月雅，打断了他们的对话。以“制御者猎人”而闻名的她，听到和哉的传闻后，为了将和哉吸收成自己的制御者而来。当完全不把雅放在眼里的和哉回绝她之后──！？

在和哉的冰冻结界能力的协助下，莎堤莱萨顺利击败高年级生的雅。但是，这也等於是她将与所有的三年级生为敌……。实际上，三年级学年排名第7的英格丽‧伯恩斯坦也随即出现在莎堤莱萨面前，宣布要全力惩罚破坏秩序的莎堤莱萨。和哉知道此事后，再度要求莎堤莱萨让他成为制御者。虽然莎堤莱萨一度感到犹豫，最後还是冷漠地赶走他并决定独自前往应战。她趁着某个制御者不在的夜晚，前往英格丽的宿舍……！？

与英格丽一战后，莎堤莱萨发现自己被和哉触碰也不会感到不舒服。她以不进行洗礼为条件，答应让和哉成为制御者。终于如愿当上莎堤莱萨的制御者的和哉，当晚受邀到莎堤莱萨的房间。当天傍晚，和哉在前往女生宿舍的路上遇见一名穿着奇特的女性。原来她是从西藏转学来的拉娜‧林沁，似乎在校内迷了路。和哉带拉娜到校长室後随即前往女生宿舍，但在宿舍入口却被2年级的奥黛莉叫住……！？

在拉娜的救助下，和哉勉强逃过被奥黛莉等人集体私刑，但这几天连续发动冰冻结界的和哉仍因为体力透支而昏倒。莎堤莱萨得知此事后随即赶往恢复中心，并整晚陪着昏迷不醒的和哉。虽然两人的距离渐渐拉近，但救助了和哉的拉娜看到和哉的温柔个性以及冰冻结界的能力后，将和哉认定为自己命运中的白马王子。隔天，转学到莎堤莱萨班上的拉娜，主动要求坐在莎堤莱萨隔壁的座位，并主动表示“和哉就是自己命运中的白马王子”……！？

莎堤莱萨与拉娜的这场私人恩怨对决，随著和哉将事实告诉拉娜而落幕。但此时，阿蒂亚‧席梦思、亚妮特‧马克米欧连与克蕾欧‧布朗得这三名三年级学姐突然现身。他们原本只是旁观莎堤莱萨与拉娜的战斗，但看到计画失败後，决定亲自出马对莎堤莱萨展开制裁。莎堤莱萨虽然满身是伤，但仍打算独自接受亚妮特与克蕾欧的挑战。最後拉娜也加入战局，展开莎堤莱萨VS亚妮特，以及拉娜VS克蕾欧的激烈生死决斗！

莎堤莱萨与拉娜发挥惊人的力量，最后终于成功击败三年级学姐。看到连三年级第四名的亚妮特也被莎堤莱萨击败，为了清楚掌握莎堤莱萨的真正实力，三年级的学姐们决定暂时停止对她的制裁。此时，校内正准备举办一年一度的例行活动“毕业舞会”。莎堤莱萨因为听到和哉答应跟她一起参加舞会而感到高兴，此时阿蒂亚突然出现在她的面前，并向莎堤莱萨要求在选美大赛“潘多拉女王”一决胜负……？

某天，和哉受邀来到东杰尼提克斯。他先是参观由被称为“东之神速”同时是学年第一名的凯西‧罗克哈特所示范的对NOVA模拟战斗，接着又从凯西口中得知她也是拥有和哉姐姐英痕的人之一。但是凯西却说她不会升上4年级，而是打算将英痕让给学妹，改而去实现成为小说家的梦想。听完凯西诉说完自己的梦想后，和哉踏上了归途。没想到在此时，他接到在东杰尼提克斯出现4架NOVA的消息…！？

这次出现的4架NOVA，明显与过去都有所不同。他们先是将潘多拉吞噬，消失不久后又突然出现将西杰尼提克斯团团包围！虽然师生们对于NOVA这种有明显目的的行为感到困惑，但校内的所有潘多拉仍全力准备迎击NOVA。此时，莎堤莱萨得知和哉之所以会喜欢上她，是因为她身上拥有和叶的英痕。当莎堤莱萨知道和哉只是把自己跟他姐姐重叠在一起后，变得不知道该如何跟和哉相处，最后甚至说要独自去参加这场艰难的战斗！

一群受到NOVA控制的潘多拉，朝着位于西杰尼提克斯中央的“雷文斯伯伦‧纽克勒奥奇德”最底层攻去，他们的目标是夺取藏于该处的圣骸。其中已化为NOVA的凯西成功闪避3年级的攻击，抵达安置圣骸的房间门前。但是被召集来的莎堤莱萨与和哉等人，早已在这里等待。

与化为NOVA的凯西展开对战的莎堤莱萨，设法破坏控制凯西的胸前圣痕，让凯西得以暂时恢复自己的意识。但还来不及高兴，莎堤莱萨就被凯西的圣痕释放出的强烈光束笼罩。莎堤莱萨原本已做好牺牲的觉悟，但却在加妮沙的舍身拯救下保住一命。直接受到光束攻击而身负重伤的加妮沙，她死前的一番话让莎堤莱萨第一次感受到什么是伙伴。这场战斗后也让莎堤莱萨知道自己该保护的是什么，接着她任凭自己化为NOVA，再次挑战凯西！