某日走在河边的夏目，突然听到有东西碰撞的声音，接着就看到头戴着壶的妖怪在撞墙。原本夏目不想多管闲事，想悄悄走掉，却被妖怪拜托把壶拿掉，之后还为了回礼，用他“日月食”妖怪的力量，把夏目变成小孩，还因此让夏目失去原有的记忆…

回家途中，夏目发现大岩石上浮现美丽的花朵模样，但身旁的塔子似乎看不见，后来和西村与北本一起去钓鱼时，又在岸边看到有图案的石头，让夏目怀疑可能和妖怪有关，但犬之会却说那是专门帮不干净的石头与岩石洗净的妖怪石洗大人所为，没多久石洗妖怪“七卷”出现了，要夏目帮忙寻找失踪的弟子。

被小学同学柴田硬找出去的夏目，带着猫咪老师和原本有约的田沼一起去。由于柴田知道夏目看得见妖怪，因此告诉夏目有一个半夜会发出怪声的“外木人偶屋”传说，当一行人来到屋子前，夏目和屋子里的奇怪东西对上了眼…。

夏目和猫咪老师在街上发现名取的纸人偶，上面只写着地点和时间，夏目因为担心名取的安危，决定前往查看，结果遇到一名叫月子的女性。月子看到夏目全身淋湿，想借夏目雨伞，所以把他找进家里，没想到天花板传来很大的响声，据月子表示，最近常听到奇怪的声音……。

夏目遇到的月子小姐，是最近因为看不见妖怪而停业的除妖人，也是带领名取进入这一行的拓间的女儿。她感到家里不对劲，拜托名取来帮忙调查，才发现是拓间的前式神们，因为没有进行解约仪式无法获得自由，才打算引灾难进这个家，但夏目始终觉得有异，决定和名取联手调查屋子，却被前式神攻击…。

西村和北本回想起刚上高中时的事，他们二人看到转学进来的夏目，虽然常以笑容响应大家，却似乎始终与人保持距离。某一天西村发现夏目倒在公园里，尽管夏目一直客气地婉拒，担心夏目的西村仍执意将夏目带回家休息。

夏目过着将名字还给妖怪的奇妙生活，但这一天却有妖怪前来表示要向铃子道谢。这名自称御持的妖怪住在七房森林里，而当年铃子似乎造访了森林，因此结识御持，并在森林妖怪们的请求下，想阻止森林中妖力最强的“千纪”和“百户”的争吵。

夏目放学后因为捡到信而认识了“葵”，还被葵要求带去学校找从小一起长大的女孩“小香”，尽管夏目觉得狐疑，仍带葵去学校，并碰到正要回家的西村，得知西村看不到葵，这才明白葵是妖怪，更得知小香也看得见妖怪，但葵因故和她斩断了缘分。

夏目因参加学校的集训教学，造访了在住宿处河川另一边的祠堂「四面冢」，据说里面供奉四个面具，缘自四名跟随山神大人保护山的守护者，但除了夏目外，大家都只看到三个面具，尽管夏目极力不去在意，但在大雨造成河川泛滥的隔天，目击到一名乘着小船还把头埋进水里的女性…。

除妖人名取开始打探关于夏目手上的“友人帐”情报，而这一天夏目受塔子之托，要将果酱送去给名取，两人碰面后遇见同为除妖人的会宫，还告诉他们以研究妖怪和妖术闻名的箱崎已去世，其孙女表示谁能找到藏有许多研究数据的书房，就能将所有数据拿走，夏目决定跟去寻找关于友人帐和消除名取脸上蜥蜴的数据。

夏目和名取一行人拼命寻找箱崎宅邸里隐藏的书房，的场一门的七濑也来了，而夏目更在搜寻途中遭妖怪袭击，还被名取听到友人帐的事，因此决定在事情结束后向名取和盘托出。一行人于是重新寻找，并以看得见枫树的居室为主，而夏目终于发现箱崎的全家福照片，还看见照片上有二条疑似是箱崎式神的龙。

要去七辻屋买东西的夏目和猫咪老师，中途帮忙背一位倒在路旁的老人家回去，老人家表示自己是妖怪，住在隔壁村神社参道旁的银杏树根上，前阵子因为雷击被劈断，还说再不久就会回归尘土，但因为想起曾和人类做过约定，在回想起来之前，希望夏目能天天帮他浇水……

夏目与猫咪老师为归还妖怪名字，来到人迹罕至的异界森林、福音森林，并遇见高中女生珠实。夏目打算送珠实到森林出口，但珠实表示自己是受白色猫头鹰之托来到这里。数日前意外被珠实搭救的白色猫头鹰，在珠实帮它重新戴好脚上的红石指环前就飞走了，并在昨夜出现梦里，要珠实把指环拿去森林还给它……