由於中了水族族长灵水的邪气法术，小薰的身体将会腐烂而死。而解药只有武藏野的地下龙脉泉水。剑心与阵风冒着生命危险来到武藏野，在隧道里突破层层障碍後终於找到泉水，却发现龙脉之气已经被水族歹徒所利用，并且朝着东京府内前进，意图毁坏着名的德川家。