剑心与阵风终於取回龙脉泉水，救回小薰的性命。二人随即又启程转往日光东照宫，欲找寻改变龙脉流向的地点，以拯救整个东京。然而，关键所在却是德川家康所留下来的一枚翡翠纹章。该纹章原本被嵌在家康灵庙的阳明门上，当剑心寻到时却已遭人掉包。