为了解读翼和玛利亚从巴贝韦德共和国带回来的机密资料，S.O.N.G.的各位访问长野县松代国土安全保障的要地“风鸣机关本部”。装者们担负着周边的警戒任务，但最后的LiNKER已经用完了，无法装备Symphogear的玛利亚、调、切歌掩饰不住心中的焦虑。另一方面，巴伐利亚光明结社的炼金术师们为了执行统制局长亚当下达的“Symphogear破坏命令”，圣日耳曼正着手炼装铠的完成。心急的卡里奥斯特罗袭击S.O.N.G.，不过无功而返。而后战斗中，为了消灭大量Alca-Noise，响等人拔剑启动IGNITE模块，然而那是个圈套。终于穿上利用了“贤者之石”的炼装铠的圣日耳曼、卡里奥斯特罗、普勒拉蒂将IGNITE模块破解，响、翼、克莉丝命悬一线。而且，亚当突然乱入，宣称在此时此刻进行“黄金炼成”——