在与神秘敌人“亡灵（Gespenst）”的战斗中木偶遭到严重破坏的大介，正在为把居民也卷入战乱中这件事所问罪。与此同时，修订者正在逐渐地落实把涩谷传送这一事情确定为已成事实这一计划。这样下去的话就再也无法回到原来的时代了。S.D.S.到底能否保护大家的未来……