“北部帕特里亚同盟”与“南部帕特里亚联合”。为了终结这常年持续的内战，“北部”用上了禁忌的力量。“拟神兵”，在这被誉为神的力量之下，战局一下子就得以逆转。“拟神兵”作为带来战争上的胜利的英雄而被人们所尊敬着，但这股非人的力量也是一把双刃剑，在辉煌的战果背后，“拟神兵”们的命运逐渐变得疯狂。于是，“拟神兵部队”队长的“汉克”立下了一个誓言。

在利夫雷特村的尽头，少女夏尔和经营孤儿院的父亲威廉和孤儿们过着朴实的生活。但是由于内战，物资价格高涨，夏尔等人不得不自给自足。有一天，军方情报部访问了威廉。被告知具有特别的适应性的威廉，为了夏尔他们的未来，决心前往战场。不久内战结束了，威廉回到了村子里。拟神兵却成为不被需要的一方。

和父亲的仇敌，狩猎野兽的男人汉克一起旅行的夏尔。两人前往的地方是耸立着巨大要塞的街道“罗格希尔”。野兽聚集到了现在还没有结束战争的街道。在那里等待的是支持汉克的军人们。据她说，建造要塞的是拟神兵米诺托劳斯。汉克怀抱着自己立下的誓言前往要塞。

汉克和夏尔乘着蒸汽机车驶向国境。架在国境之谷上的大陆第一的铁桥，位于北部和南部的境界，被称为和平的桥梁，支撑着生活在战后的人们的生活。为了阻止像逼近那座铁桥一样不断前进的拟神兵贝希摩斯，汉克被唤到了这里。

蒸汽都市白丘奇为了寻找能够释放出世间拟神兵的男人凯恩麦德豪斯，以及来到了这里的汉克等人，根据莱萨的情报，贫民街的一角，每晚都有居民被杀。为了逼近这个目的，开始调查的汉克们收到了更大的牺牲者的情报。从尸体上留下的爪痕中断定不是凯恩干的。那里出现了目击者并作证。说是“恶魔石像做的”。汉克通过这句话知道了敌人的真面目。

终于现身的宿敌男子凯恩麦德豪斯。被突然袭击，动弹不得的汉克，夏尔也被抓走了。为了夺回被夺走的夏尔，汉克答应了凯恩的邀请，做好身陷圈套的觉悟只身前往夜会。那里是聚集着衣着靓丽的富裕阶层的派对。不久，在热烈的掌声中出现了宿敌凯恩。

凯恩·麦德豪斯策划白色查奇事件后，汉克消失了。并且，在夜会上凯恩发表的宣言，不久就变成了震动帕特里亚全境的大动乱，战争的脚步声再次接近帕特里亚。在那之后约一个月后，故乡利夫雷德村出现了“夏尔”的身影。

为即将到来的战争做好准备，急于扫荡拟神兵的北部帕特里亚联合国。港口城市波特加尔夫，有等待补给船的拟神兵讨伐部队库德格莱斯队长克劳德的身姿。随着时间的推移，一个人在岸边漫步的夏尔，听到了虚幻而美丽的歌声。

白丘奇暴走后，害怕野兽的力量而苦恼的汉克。被打倒的伙伴们变成幻影，责怪他。就在这时出现了曾经的部下拟神兵“加尔姆”。在荒芜的雪中，汉克以人类的姿态与加尔姆对峙。在那里，拟神兵讨伐部队“库德格莱斯”逼近！

在内战时代，两人都靠着背战斗，现在却因为意志的不同而敌对了汉克和罗伊。两人作为拟神兵展开了激烈的肉搏战，但由于拟神兵讨伐部队库德格莱斯的闯入，汉克从悬崖落入了深谷。为了曾经的伙伴而苦恼的汉克，在混浊的意识中遇到的人是……。

为了集中力量攻克要塞而编组的北军攻略部队。在那里会合的克劳德率领的拟神兵讨伐部队“库德格莱斯”。其中有一个身穿制服的，根据攻略部队指挥官马丁华尔兹上校的话，敌人是拟神兵肯塔罗斯和迈尔斯巴隆。在战场上看到的和以前一样的“迈尔斯”面前，“哈克”采取的行动是……。

对峙的两个拟神兵汉克和迈尔斯。相互确认般的话语，力量的对决。展开了激烈的攻防战的两人。仇人凯恩以意想不到的形式出现在猎人面前，然后，击破艾伦并释放出拟神兵的男子对汉克说出的野心是…？