地球正遭受来自“红之世界”的侵略者“Nightfly O'Note”的威胁，为了与之对抗，人类设立了防卫机关“LAG”，并组成对战斗单元“Scared Rider”。不久之后，名叫麻黄明的少女以教官兼指挥官的身份前往LAG赴任，刚一到任，停止的Nightfly O'Note再度开始活动，第六战斗单元的成员们为了守护世界，投身于战场。

名叫麻黄晶的少女以教官兼指挥官的身份指导第六战斗单元，由于在没有变身的情况下闯入红之结界，阳介受伤住院。逃出医院的阳介巧遇晶，阳介对这位新教官似曾相识。原来麻黄晶就是阳介从飞机中救出的少女，她的记忆被上层调整，而上层策划的“六人计划”究竟是什么？

Nightfly O'Note重新开始侵略已经三个月了，红伤骑士屡战屡胜，但广的战斗状态让人担忧，长官认为广的团队能力不足，他计划将广从骑士中除名。为了阻止这种情况，晶对红伤骑士展开以强化团队合作为重点的训练，在裕二的提议下，大家组建乐队。害怕被恐怖怪物追赶的广，能克服心理障碍吗？

为了向大众宣传LAG和骑士们的亲切，晶进行“秘·宣传计划”，这一次红伤骑士们来到湘南的海边拍摄健康饮料广告，晶还提到要大家作为乐队Odd-I's出道，拓斗对此十分不满，认为不应该花时间在与战斗无关的事情上。晶决定在湘南拍摄Odd-I's新曲的宣传影像，在此之前大家尽情享受海边的悠闲时光。

第六战斗单元迎来插班生，轻佻的迷之心机男无月圣，而圣和晶似乎很早就相识了。第一天新人报道圣就缺席了，其他骑士对他都很不满。晶察觉到圣的身份不明，她和阳介暗地跟踪圣。而另一边的拓斗也跟着华瑚来到通讯室，得知上层打算舍弃琉璃将机能转移到东京，阴谋渐渐浮出水面。

琉球LAG的公开日，在学园祭上乐队Odd-I's将迎来初登台演出。为了第一次的演出，乐队全员努力练习，但会来的客人并不如预想的那么多，因此宣传Odd-I's就成了大家的首要任务。新成员圣对乐队和主唱拓斗冷嘲热讽，并拒绝加入Odd-I's。就在队员们分发传单的时候，奇怪的客人来访。

最强的敌人，名为GRUNBACH的极限型Nightfly O'Note袭击琉球LAG总部。骑士们无法共鸣变身，控制室也无法接受外界消息，总部陷入前所未有的危机。GRUNBACH轻松闯入控制室，并向总长石寺正式宣战。晶遭遇GRUNBACH，尽管圣挺身而出，但GRUNBACH还是带走了晶。由于拯救晶的迫切心愿，圣终于和自己的搭档产生了共鸣……

GRUNBACH的袭击过去了两个月，琉球LAG也基本复原了，为了缓解大家的悲伤情绪，骑士们和协助成员一起为圣诞派对做准备。华瑚把自己困在房里，晶和拓斗前来找她，而此时华瑚突然身体不适。看着晶担心华瑚的样子，拓斗把冈崎监察官准备舍弃琉球的事和盘托出，晶决定找华瑚问个清楚。而此时，冈崎监察官的阴谋开始了。

冈崎监察官的的计划发动，华瑚用枪指向晶，打算杀死晶取而代之，而她是以晶为原型制造的后备品，就连回忆也是假的。晶的一番话感动了华瑚，冈崎不仅欺骗了华瑚，还把她关进牢房。就在此时，最强的GRUNBACH向首都东京进攻，冈崎用秘密武器攻击GRUNBACH，却并未奏效。

东京受到毁灭性破坏，但还是人类取得了胜利，迎来短暂的和平，然而人类与Nightfly O'Note的战斗并未结束。拓斗牺牲自己拯救东京，他的离开给队友们造成巨大打击，然而他留下的一首新曲又让众人再次下定决心。队长的位置与主唱的麦克风有人接下了，守护世界的战斗也要继续下去。

石寺和GRUNBACH已经死去，但红之世界与青之世界仍然为争夺唯一的黄金女神而厮杀。在琉球，新的敌人出现，而他竟然是拓斗，拓斗带领Nightfly O'Note大军，以毁灭青之世界威胁LAG交出晶。阳介他们接到将晶送到琉球LAG的任务，曾经的同伴变成敌人归来，争夺要如何结束？

晶被拓斗囚禁，在他的指挥下青之世界逐渐被红色覆盖，骑士们驾驶红色机车攻向拓斗的基地，人类与Nightfly O'Note的最后决战开始，这不光是拯救世界的战斗，还是守护音乐的战斗。在同伴的掩护下，阳介与拓斗展开对决，拓斗陷入暴走阳介受伤，关键时刻队友前来支援。黄金女神完成了选择，黑暗被新生的光芒撕裂。