室江高校剑道社的顾问老师石田虎侍（绰号小次郎），与学长石桥约好要进行女子团体战的练习赛。然而实际上，剑道社的女社员就只有社长千叶纪梨乃一个人，所以小次郎开始寻找新社员。偶然间，小次郎得知一年级的川添珠姬学过剑道，因此想要邀请她加入剑道社，然而……

虎侍与新社员中田勇次，一起拟定着邀请珠姬加入剑道社的计画。另一方面，在剑道道场被卷入某件风波的珠姬，却演变成必须与高年级的男社员以剑道对决。因为体格的差距加上过于宽松的道服，使得珠姬陷入了苦战。她在这时候回想起来的光景是？

包括珠姬的新成员加入之后，剑道社的众人前往剑道用品店购买新护具。　　 当天晚上，小次郎接到石桥的电话之后，不禁拿起学生时代充满回忆的奖杯沉浸于感伤之中，却不小心发生了天大的意外。　　 另一方面，都想要对伤害荣花的外山还以颜色，此时剑道社的另一个成员-鞘子却忽然出现…？

小次郎与纪梨乃拟定策略，想要把一直缺席的鞘子找回来。或许是听到了这样的愿望，鞘子总算出现在剑道道场了，然而都却发现那天在河堤起争执的对象居然是社团的学姐。严苛的练习加上意外的邂逅，使得都对于剑道的热情逐渐冷却……

为了即将来临的练习赛，室江高中与町户高中各自热中于练习，然而室江高中就这么在少一个社员的状况之下迎接练习赛的到来。另一方面，町户高中的社员们在集合时间依然没有到齐，石桥只好到处奔走寻找她们……

室江高中与町户高中的练习赛终于开始了。展现压倒性实力的珠姬、首度参赛而感到困惑的都、在珠姬的指导之下大幅进步的鞘子、贯彻自我风格的纪梨乃。众人展现自己的个性进行比赛之後，迟到的第五名战士“武礼叶”出现了。她的真面目是……

在练习赛的最后，珠姬与对方学校的顾问老师石桥进行对战。看到即使面对大人也毫不退缩的珠姬，石桥摆出的架式是……　　 练习赛总算结束之后，双方社员和乐融融享用着纪梨乃带来的炸肉排，至于当天晚上，赢了赌注的虎侍与石桥一起前往寿司店，并且得知了令人震撼的真相……

珠姬因为某个原因而需要一笔钱。另一方面，练习过于疲劳导致身体不适的都，正在寻找帮她代班打工的人。　　 对打工感兴趣的珠姬，就这么代替都接下这份工作。由于是第一次的经验，使得珠姬紧张得全身僵硬……

即使努力做着不习惯的工作，珠姬还是很在意社团的状况，因此在打工结束之后赶回道场，和众人热烈讨论着接下来的大赛，然而虎侍回家路上顺道去超级市场购物的时候，却发生了一件左右虎侍与剑道社命运的事件……

珠姬在打工的店里，遇见一位来找都的少女，然而听到这件事的都变得心神不宁，就像是在害怕着某种东西。　　 几天之后举行了一场剑道大赛，纪梨乃从偶然遇见的国中朋友口中，得知室江高中有一名剑道实力很好的一年级学生，因此开始寻找第五名战士……

高中联赛的预赛将近，并且还要与外校进行练习赛，使得剑道社众人士气高昂。　　 得知练过剑道的一年级学生叫做东之后，纪梨乃与鞘子前往图书室想要邀她加入，却遇见一名意外的人物。　　 为了让东加入，虎侍也开始采取行动，然而他从吉河老师口中，得知了东无法加入剑道社的理由……

纪梨乃与鞘子把东带来道场练习，虽然东的实力使得众人纷纷请她加入，但东有着无法加入社团的隐情。　　 就这样在某一天，室江高中与成明高中即将要举办练习赛。由于顾问老师的教学方式过于严厉，成明高中的社员接连退出，一年级的小川芽衣也迷惘着是否要继续留在剑道社，但她却被迫参加了练习赛……

室江高中与成明高中进行练习的时候，与珠姬一起练习的芽衣，对珠姬的实力感到惊讶与憧憬。顺水推舟一同参与练习的东，在纪梨乃的劝说之下与珠姬进行对战，并且逐渐回想起剑道的要诀。另一方面，虎侍从林老师口中，听到了他对剑道的意外想法。　　 就这样，练习赛开始了……

纪梨乃与鞘子继续劝说着东加入剑道社，东则是表现出断然拒绝的态度，虎侍也表示不希望强迫东加入剑道社，使得两人相当失望。看到两人的这副模样，都朝着东的教室走去……另一方面，虎侍在石桥的游说之下，准备为接下来的高中联赛举行强化集训……

珠姬等人与町户高中的社员举办了一场集训，然而众人首先抵达的地方，不知为何居然是游泳池……之后，双方的交情随着练习而越来越好，在训练结束之后，两校学生一起前往澡堂洗去身上的汗水，并且在吃过晚餐之后大家玩得像是校外教学一样开心，就这么迎接着深夜的来临……

纪梨乃忽然连续两天向学校请假。由於无法取得连络，担心的鞘子溜出道场赶往纪梨乃的家，但她目击到的却是纪梨乃帮家里看店的身影。在高中联赛县内北区预赛，室江高中在女子团体赛过关斩将，但是接下来的对手东城高中，流传着一些负面的传闻……

珠姬被东城高中的社员们陷害而受伤，但她为了避免大家担心，假装成若无其事的样子上场比赛。　　 与东城高中的比赛开始了。不只是珠姬，东与纪梨乃也抱持着身体或精神方面的问题上场。终于，珠姬即将与东城高中的大将．小西进行比赛……

室江高中与东城高中的比赛，以预料之外的结果划下句点，社员们各自怀抱着不同的想法离开了比赛会场……　　 当天晚上，纪梨乃传简讯找鞘子商量，希望趁着剑道社重新开始的这个时候制作吉祥物与主题曲，然而这个想法引发了意料之外的悲剧。

对于接下来的关东大赛，室江高中剑道社的社员个个摩拳擦掌，并且在这天举办了社团的个人赛，然而都却连一分都拿不到。关心都的阿段，陪着她一起前往用品店购买新的竹剑。　　 在店内，两人与偶然遇见的外国女高中生西川凯莉起了一点小争执，最后演变成将剑道社卷入的大麻烦……

虎侍出差所以社团暂停练习的这个周末，勇次拿到两张游乐园的门票。珠姬得知超剑战队将会在游乐园的舞台剧客串演出，因此决定和勇次一起去看。　　 听到超剑战队亲口宣布新作剧场版的计画，珠姬感到非常开心，但她却因为想要得到纪念品，与在场的另一名少女铃木凛针锋相对……

珠姬父亲的朋友，小泽剑友会的成员们，为了拍摄剧场版超剑战队而来到珠姬家的道场，跟着他们一起过来的，还有那天在游乐园遇见的铃木凛。　　 珠姬开心参观着动作场面的排练，并且和凛聊超剑战队的话题聊得很尽兴。隔天，珠姬与凛一起到拍片现场参观，现场却发生了一个意外……

随着关东大赛的来临，都逐渐展现出特训的成果，剑道社众人也紧锣密鼓进行着练习。纪梨乃将亲手制作的玩偶交给大家，祈求能够在比赛中获胜。　　 就这样，关东大赛开始了。众人在会场遇见石桥率领的町户高中社员，双方发誓要在会场较量，珠姬也在这里再度遇见凛。此外西川凯莉也在第一场比赛的对手名单之中……

关东大赛的结果使众人士气低落，剑道社的气氛变得与平常不太一样。些许格格不入的感觉在社员们身上留下阴影，并且逐渐变成深深的裂痕。　　 在这时，外山与岩佐惹出了一个风波。以这个事件为契机，虎侍与纪梨乃被迫面临一项重大的抉择……

剑道社社员们的心意变得四分五裂。都因为找不到继续练习剑道的意义而没去练习，阿段则是因为自己帮不上忙而陷入低潮。东在街上看见这样的都之后，采取了某种行动……　　 另一方面，面临社团遭到废除的危机，纪梨乃也请假没去上学，担心她的鞘子则是……

重新下定决心的室江高中剑道社，参加了升龙旗大赛。虎侍与石桥回忆着十年前曾经在这里对决的往事时，社员们正在报名参加个人赛。在会场上，都遇见了凯莉，珠姬遇见了凛，众人怀抱着各自的想法而燃起斗志。另一方面，参加男子个人赛的勇次与阿段也各自过关斩将……

时光流逝，在别离与相遇的季节，珠姬和凛重逢并且一起上街。几天之后的放学时间，在乍看之下一如往常，却有着些许不同与些许不足的剑道社里，出现了两名陌生的访问者……