由于父亲调职的缘故，里见孝太郎从高中入学後开始独自一人的生活。他找到的「可乐娜庄106号房」是房租仅5000元的超便宜问题套房。那天晚上，「幽灵」东本院早苗出现在孝太郎的面前主张自己的先住权！紧接著「Cosplayer」打破窗户闯入、地下底下还出现了「地底人」，而「外星人」竟然也从墙壁上出现了！接二连三出现的可爱侵略者们与孝太郎之间壮烈（？）的战斗，就此展开了序幕！

由于在「可乐娜庄」的房东静香的强迫下签署了「可乐娜陆战规定」，侵略者们也开始思考因应之道。而在入学日当天加入的「编织物研究会」中，让会长樱庭晴海教导编织也成为了支持孝太郎吉祥春风高中生活的心灵绿洲。然而在这时却出现了四名转学生‧‧‧。使出各种手段的她们，现在终於连孝太郎的高中生活都要开始侵略了！

为了参加两人一组才能报名的社团障碍马拉松对抗赛，孝太郎向编织研究会的学姐樱庭晴海提出一同参赛的请求。另一方面，提亚与奇莉华为了获得比赛的胜利，也都各自在私底下默默地准备著。比赛当天，孝太郎与可乐娜庄106号房的侵略者们都跃跃欲试，但没想到在比赛开始没多久就发生了出乎意料的大骚动！

商店街的抽奖,抽到了海边的温泉旅馆的住宿券,一行人暂时停止了106号室的攻防战。为了盛夏的避暑。大家一起来到了泳衣商店,早苗不仅是快乐的样子…… 。 孝太郎因为意外的避暑旅行与樱庭晴海产生了良好的氛围。但是,兴奋的美女军团出现了可疑的影子—— 

“我们是敌人”——被孝太郎所说的受到打击,早苗一个人离开了旅馆，被幽灵猎人囚禁了起来! 依靠由莉佳的目击情报,为了救出早苗的大家站了起来,攻入了敌人的巢穴…… 。此时,被女恶灵看透心思的变得早苗变得更加惴惴不安。恶灵们的目的到底是什么? 孝太郎的王牌是——!

文化祭之前, 为了帮助还没有决定演出剧目的话剧部,孝太郎一行人为了得到侵略分数而进行剧本对决。 提亚执笔的《白银的公主和蓝色骑士》以微弱优势被采用了。樱庭晴海被选拔为公主角色,被发现拥有着夺人眼目意外才能！此时，提亚把担任晴海练习对象的孝太郎与真正的蓝色骑士重叠了…… 另一方面,由莉佳在这三坪房间中带进了…… 动乱发生的预感!

为了文化祭，孝太郎接受了来自提亚的大量的青骑士特训。 在一行人各自忙于准备的过程中,舞台出现了未曾相识的人物…… ? 有一天的练习中,提亚为了从倒下的器材中保护孝太郎而受伤。 为了剥夺提亚继承王位的权利，可蓝出现在这里并攻击了他们。 彼此了解的提亚和可蓝,展开激烈的战斗! 
另外,独角仙生命的危机也出现了——

谁也不相信由莉佳是魔法少女。 这时“邪恶魔法少女黑暗彩虹真希”转入了吉祥春风高中! 真希的真实身份是同样的魔法少女,就算说出了“可乐娜庄106号室”的危机, 孝太郎一行人也仿佛充耳不闻。 甚至进行了“可乐娜庄”的真希欢迎会… 。 晴海给由莉佳进行了力量，三坪房间和为了保护队友斗争的决心,——

晴海面对着倒下的由莉佳? 不可思议的光包围了晴海,被授予魔法剑的孝太郎为应战与真希一起消失了。 另一方面，在校内的提亚和奇莉华担心着与她们失去联系的孝太郎。 听到了由莉佳成为魔法少女的经过，孝太郎和晴海与她一起战斗，向着“可乐娜庄106号室”前进。已经控制了真希和魔力以后,满身疮痍的由莉佳的决心是——

因为奇莉华的请求,大家主演了幼儿园的英雄秀。演出顺利进行的时候,也‘太阳部队Sun ranger’突然闯入了表演! ?无视突然出现的敌人,表演中可谓盛况空前,落下了帷幕。 表演后突然消失踪迹的奇莉华,居然在商店街进行着清扫志愿服务…… 。 孝太郎,看着地面侵略者的她和小镇上的人如此亲密说话的样子,感到了比以前更强的违和感。
“奇莉华的侵略方式太温柔了”——

奇莉华邀请孝太郎的目的地,是以前来过一次的游乐场。早苗一行人跟随他们二人进入了电影院,那里是“昆虫战士超战士”的英雄秀会场! ?这里是因为消失的露丝而不安的大家。另一方面,是与像孩子一样兴奋的奇莉华乘上摩天轮的孝太郎。 于是说出了她地面侵略的目的和，初恋的故事。但是此时从地下传来一声令人毛骨悚然的巨响——

终于安定下来的“可乐娜庄106号室”共同生活的12月,学校里总是围绕着圣诞节的话题。 开始排练《蓝色骑士》的续集的时候,孝太郎偷偷地增加了兼职。 “无法成为恋人? !” 既兴奋又焦急不已的孝太郎被周围影响着。三坪房间的攻防战到底会如何继续呢……