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新学期开始，纯还是拒绝上课，蔷薇少女们聚在樱田家，再一次吵起嘴来。翠星石和苍星石夺窗而入，寻找躲起来的雏莓，又是一场因为梅大福而引起的战斗。相比同伴的开心日常，真红显得心事重重，她还在为水银灯担心。而此时，神秘的第七人蔷薇水晶登场，她的目的是？
在N之领域，蔷薇水晶与真红展开激战，真红被打败，就在被摧毁的那一刻，有人救了他们。没有人知晓的第七少女，最后的姐妹苏醒，意味着爱丽丝游戏进入了最后阶段。真红不希望任何人因失去蔷薇圣母而成为真正的人偶，于是内心拒绝战斗，还打算把蔷薇水晶的事隐瞒起来。
蔷薇少女们聚在樱田家，还是向往常一样吵闹。自称是蔷薇少女中第一的头脑派，第二人偶金丝雀准备夺取蔷薇圣母，趁纯和姐姐都出门的机会突袭真红她们。然而金丝雀的计划并不成功，不仅暴露了踪迹，还把自己浑身搞得湿漉漉的。这下子所有的蔷薇少女都出现了，形势更加严峻。
为了应对爱丽丝游戏，翠星石也开始寻找自己的主人了。屡屡遭拒的翠星石想到了纯，她想和纯缔结契约，但傲娇的她根本说不出口，而且纯似乎也没有这个想法。就在此时，蔷薇水晶再次出现，将大家带到N之领域，展开爱丽丝游戏间的战斗。真红和苍星石纷纷落败，纯终于决定与翠星石签订契约。
尽管纯也是翠星石的主人了，但他整天还是和真红黏在一起，这让翠星石嫉妒不已。为了让纯对自己另眼相看，翠星石打算帮忙做家务，却又闯了大祸。在雏莓的启发下，翠星石决定抢在雏莓之前，给纯寄信。而另一边，金丝雀又在计划着报复真红她们了……
水银灯因为没有被真红拿走蔷薇圣母重新复活，这次她的契约者是一心求死的重症少女小惠。小惠称水银灯是来取走她生命的黑色天使，并恳求水银灯一口气用光自己所有的生命。水银灯遇到了蔷薇水晶，想起了自己输给真红的事。准备复仇的水银灯找到真红，却看到了真红的泪水……
翠星石、苍星石和雏莓学着做饼干，没想到真红竟然也加入进来。就在大家其乐融融的时候，金丝雀又来了，然而真红不但没有生气，还邀请金丝雀一起吃饼干，这让苍星石沉默不语。为了满足主人的期待，金丝雀终于展现出了真正的力量，但还是被真红秒杀。最后大家一起来到金丝雀的家，开起了换装舞会。
苍星石在镜子中见到了因为找不到爱丽丝而哭泣的父亲大人，因此告别了姐妹们，下定决心加入爱丽丝游戏。尽管翠星石哭着挽留她，但苍星石还是离开了。而另一边，水银灯看到小惠病危，蔷薇水晶找到了她，称蔷薇圣母可以救活小惠，一向独来独往的水银灯，选择了与蔷薇水晶合作。
在N之领域，苍星石、水银灯、蔷薇水晶准备展开对战，翠星石四处寻找苍星石却一无所获。在这种氛围下，大家举办清流素面派对，但翠星石还是打不起精神，看着姐妹们拼命想逗自己开心，翠星石终于笑了。深夜，水银灯和蔷薇水晶前来挑衅，真红不为所动。水银灯袭击翠星石，苍星石终于出现了。
苍星石的蔷薇圣母被水银灯抢走，攻击力更加强大。拉普拉斯宣告爱丽丝游戏的第一幕结束，于是众人回到现实世界。水银灯想用蔷薇圣母拯救小惠，却被蔷薇水晶告知必须集齐所有的蔷薇圣母才行。纯找到槐，希望他能修复苍星石，却被对方告知已启程去远方的灵魂无法回来了。被真红打败却没有被真红拿走蔷薇圣母的雏莓在游戏完全展开时，不得不变成人偶。
最后决战在N之领域的蔷薇园进行，纯为了阻止战斗跟着也进入了蔷薇园。水银灯对战真红，蔷薇水晶对战翠星石。就在蔷薇水晶将要杀死金丝雀时，翠星石因不想再看到任何人失去蔷薇圣母，毅然牺牲自己保护了金丝雀。当金丝雀看到翠星石为保护自己而失去蔷薇圣母，原本胆小的她勇敢的拿起了小提琴……
