剑心终於跟齐藤、左之助会合，和警方合作开始展开围剿志志雄的行动。首先他们探出志志雄打算在夜里放火烧掉京都，於是联络御庭番众的新头目小操，立即飞鸽传书通知散布在全京都的御庭番众，和民众联手防范火灾的发生，终於阻止了京都大火。另一方面，志志雄带着手下亲信，搭乘「炼狱号」军舰准备开往东京，炮击东京，这个计画也被剑心识破，众人立刻赶到港边阻止志志雄出航，然而炼狱号的火力实在太强了‧‧‧。