浦岛景太郎是以东大为目标的重考生，重考两年都名落孙山，就在准备第三年重考时，突然被要求担任他奶奶所经营温泉旅馆的管理员，事实上那已经是女生宿舍，他阴错阳差被误认为是东大高材生，在不得已的情况下决定留下来，但是里头的女房客可不是简单的角色。

因为父母要离婚而被迫搬家的前原忍心里很难过，虽然她在学校也没有朋友，但是她仍然舍不得离开雏田，尤其她在雏田庄也有许多儿时的回忆，偶然认识了景太郎，让她燃起对生命的希望，于是她决定要留在日向庄，并且要打开心胸拥抱生命……。

集训回来的青山素子看到景太郎的出现十分生气，但是看着他时却又感到脸红心跳，难道这是她的初恋？！在又羞又气的情况下，素子凭著高竿的剑道技术追得景太郎到处逃窜，最后素子再度脸红心跳，就医诊治才发现原因，竟然是因为感冒发烧所致，一场尴尬的初恋无疾而终……。

虽然不是有意隐瞒，但当景太郎重考生的身份曝露时，还是引起日向庄所有房客的不满，但在成濑川奈留的帮忙下，景太郎立下做好管理员工作，和一定要考上东大两个誓约，得以留下，而景太郎不小心看见奈留日记的内容，发现她15年前也和别人有过约定！难道，奈留就是景太郎朝思暮想的她吗？！

终于到了东大考试这一天，景太郎在慌乱之中完成了大考，可惜最後结果出来，他仍没考上，但意外的是奈留居然也没考上，让景太郎更绝望的是，奈留并不是15年前的那个女孩，失望的两人各自踏上旅程，目的地却同样选择京都，虽然还是不免斗嘴，但是他们似乎更了解彼此。

景太郎和奈留决定一同畅游京都，但是绀叶美津她们却误以为他们两个是去私奔殉情。同时景太郎和奈留在京都碰见了奇怪的女孩——乙姬睦美，她的热情让景太郎和奈留之间微妙的感情慢慢滋生，虽然在关键时刻，绀野美津她们突然出现，但景太郎心中越来越明白也决定要留在日向庄好好思考未来！！

今天是奈留的毕业典礼，东大落榜加上学生生涯的结束，让奈留感慨万千，景太郎为了安慰她，想要带她去新开幕的游乐园玩，准备计画一次美好的约会。想不到坂田健太出现在景太郎面前，但是奈留却做出了最好的选择？！

自从景太郎到日向庄当管理员以来，为奈留等人的生活带来莫大的影响，其中素子也深深感觉到，自己的气势不如从前，甚至剑术也有退步的迹象，于是她决定到庙里去打坐，想不到迷迷糊糊中，在游戏里又被景太郎牵着鼻子走，展开了一场龙宫传说与大魔王的对战！！

景太郎保管的租金竟然不见了，在美津的推理之下，发现大家似乎都有不在场的证明，奇怪的是，奈留似乎有什么不可告人之事？！景太郎以为奈留就是犯人，但为了保护她，决定带着她逃跑，在一阵天翻地覆之下，美津才在浦岛晴香的逼问下说出她是这场恶作剧的始作俑者。

月夜里突然出现了一个神秘的美女，她来无影去无踪，在黑夜里穿梭，原来那是卡欧拉·苏因为对哥哥兰瓦·卢的思念，使她碰到红色月亮时就会瞬间长大！长大的苏把景太郎当作是哥哥般仰慕，於是在卡欧拉的姐姐阿玛拉·苏指引下，景太郎决定自己帮助卡欧拉解决问题！！

奈留在健太郎的牵引下成了热门的偶像，访问、唱歌等通告，让她放下了重考的事情，也让景太郎感到十分不解！失去家庭温暖的奈留，彷佛是很享受这种人人都爱她的生活，但心中仍然对日向庄有所不舍，直到景太郎对她的一番鼓励，让她找到自己最想走的路，那就是朝东大而努力！！

素子因为自己的衣服都洗了，所以不得已被迫穿上女孩子的衣服，美丽的素子让大家都看得目不转晴。但素子却认为，这样的衣服会夺走她的力量，这时卡欧拉做的机器蛋突然发狂捣乱，而素子也因为衣服的关系使不出力量。在经过景太郎的提醒之下，素子终于明白穿什么并不重要。在千钧一发之际，素子终于让机器蛋停止了运转。

情窦初开的忍觉得初吻是小女孩转变成女人的重要历程，于是胆小的她鼓起勇气要把初吻献给景太郎！！景太郎会接受这段飞来的艳福吗？哦——这回是羞涩的青春记事唷！！

日向庄面临破产的危机，为了日向庄，所有的人都跑出来打工。就在阴错阳差之时，景太郎竟然遇到了奈留仰慕的濑田记康！惨了！惨了！可怜的景太郎要失恋了呀……！！

奈留终于和正在日向庄后院考古的记康见面，见到记康的奈留紧张的不知所措，景太郎心中虽然很难过，仍默默祝福她和记康。但机器蛋又发动攻击啦，大家因此被困在垃圾处理场，眼看就要完蛋了，没想到景太郎却决定在死前大胆告白罗！！

夏天到了，浦岛晴香带着景太郎一行人到海边的海滨小屋打工，为了替日向庄多赚一些钱，他们决定要演一出“西游记”，但是说的容易，演的却是一出闹剧，加上突然冒出来的记康让景太郎更是不知所措！！

白井功明和灰谷真之给景太郎出主意，想用鬼屋的办法让奈留投入他的怀抱，想不到弄巧成拙，奈留居然被妖怪附身，而唯一能救她的方法，就只有靠素子的剑法！为了奈留，景太郎充当箭靶让素子练习，哎呀！！这就是爱情的力量呀！！

在海滨小屋的打工就要结束了，这一天大家领了薪水，一起去参加夏日祭典，奈留因为前晚的误会，还在与景太郎赌气，故意和记康亲近，但是她其实非常在意景太郎，而美津在寻找失踪的莎拉·麦杜加尔同时，也流露了她对濑田的心意！

就在大家忙著帮莎拉处理转学的事情时，突然出现一个长得好像景太郎的人，但他比景太郎稳重并杰出许多，原来他是卡欧拉的哥哥兰瓦，而他这次前来是要来娶卡欧拉为妻，卡欧拉竟要结婚了，不会吧？

景太郎无意间在旧馆内发现一个人偶，令人惊讶的是，原来这个名叫萌的人偶是景太郎曾祖父浦岛景介的宝贝，而景太郎曾答应要跟萌结婚，不然会遭遇不测……！哎呀呀，奈留该怎么办？

景太郎成绩进步，决定请奈留吃饭，奈留虽然不愿承认那是约会，仍费心打扮赴约，只是景太郎的迷糊和不解风情，让难得的约会混乱收场。而当睦美拖著景太郎去约会，两人状似亲密的模样，让奈留醋劲大发，於是在公园里展开一场小船追逐……。

奈留的妹妹成濑川芽衣突然出现，打算接奈留回家，为了达到这个目的，她想尽办法撮合景太郎和睦美，希望能借这个办法让奈留失望而回家，哎呀！怎么会这样？

当奈留发现，景太郎约定的女孩可能就是睦美时，心里感到十分犹豫，不知道该不该将事情告诉他们，於是对景太郎若即若离，而景太郎看见奈留和濑田那么热闹的样子，有些话也说不出口，没想到奶奶突然回来，决定整修日向庄，要求大家暂时离开，景太郎跟奈留的误会眼看是解释不清啦？！

从一张照片中，奈留发现景太郎等待的女孩原来是睦美，这时刚好碰到日向庄要整修，就这样大家分散各地，奈留和景太郎心中都充满了不安和矛盾，不知道该不该再回到日向庄，最后在大家合力之下，景太郎和奈留终于诚实的面对自己的心情！！

素子的姐姐鹤子来到雏田庄，为了让素子回京都府继承道场，但觉得自己尚未成熟而不想回去的素子谎称要和景太郎结婚来拒绝姐姐的。姐姐不久识破了谎言并砍断素子的佩刀“止水”，说素子无需再继承道场，回归普通女生的生活。无家可归的素子穿起了女仆装，包揽了雏田庄的家务，让大伙觉得不适应。在景太郎的鼓励下，素子决定重试剑道并去挑战姐姐。然而姐姐称，如果素子在三天内不能击败自己就要和景太郎结婚。第三天决斗中，奈留无意中被“妖刀日向”附身而引起骚动，鹤子被击倒。为了救奈留，素子使出了姐姐未曾学过的绝招“斩魔剑贰之太刀”。

“如果在今天平安夜表白的话，任何愿望都可以实现”。景太郎、奈留、睦美3人为了24日的模拟考试拼命地复习，对复考生来说圣诞也好正月也好都没关系。不过景太郎有些心神不定，在学习之余还去打工，那是为了赚钱买份礼物。平安夜当天，模拟开始结束了，景太郎拿着礼物追着奈留，最后来到东京，却看到奈留把一份礼物交给了濑田的场景。产生误会的景太郎掉下礼物独自离开了。素子把景太郎买的大衣交给了奈留，美津、小忍向景太郎解释那场误会，睦美也向景太郎说明自己并不是孩童时约定一起考上东大的女孩。通过间接电话联络，二人相约在某地会面。但奈留不小心把景太郎的礼物电车里，为了取回重要礼物而奔波着，最终约定在涉谷相见。24点越来越近，在茫茫人海人群中相互寻找着对方的二人一筹莫展。最后，奈留通过记者的采访转播，传达了“我想和景太郎永远地在一起，一起考上东大”的告白；二人终于众人的欢笑中再会。

年过后应考季终于来到。以东京大学为目标的景太郎、奈留、睦美3人再次挑战考试。考试结束后，景太郎竟在留下“请不要来找我”的便条。以为考试失败的景太郎乘坐船只来海外去参加不定期的打工，那是濑田主持的古代乌龟文明的挖掘。景太郎遇到了妮雅茉（ニャモ），决定帮助雅慕完成梦想，和她一起寻找她的爷爷和古代乌龟文明“帕拉拉迪斯”。寻找景太郎的奈留来到了帕拉拉克鲁斯岛。奈留说出自己也害怕着考试不合格，说要跟景太郎一起去寻找“帕拉拉迪斯”。担心她们二人的雏田庄众房客和朋友们也来到了帕拉拉克鲁斯岛，一起见证个某个古代乌龟文明的遗迹。妮雅茉婉谢了众人的好意，决定独自实现梦想。景太郎和奈留明白到，自己的梦想必须要通过自己的努力来实现；这时众人告知他们两其实都通过了考试。曾经某樱花绽放的校道上，小忍对向自己表白的人说已有心上人，或许不能成为一对，但自己还想再喜欢他一会儿。众人赶回去办入学手续途中，小忍问奈留对景太郎的感情，奈留回答道“我对那家伙是…很喜欢的！”。